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南宫28:PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

来源:花星蕊 日期:2025-03-17

在2019年11月,加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》杂志上发表了一项关于肠道病毒感染诱发儿童急性无力脊髓炎(AFM)的研究。该研究利用PhIP-seq技术和病毒组抗原库,对42名确诊患有AFM的儿童及58名其他神经系统疾病儿童的脑脊液样本进行了检测,筛选出与AFM病因学相关的病毒特异性抗体。

南宫28:PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

研究结果显示,AFM患者组中肠道病毒抗体显著富集,并通过ELISA实验进行了验证。这提示肠道病毒感染可能是造成大多数AFM病例的关键原因。这一发现为未来开发针对肠道病毒脑脊液抗体的快速检测方法指明了方向,有望为肠道病毒相关AFM的临床诊断提供有效支持。

研究背景

急性无力脊髓炎(AFM)于2012年首次在美国被发现,之后已有超过500名儿童出现此病。在两年一次的爆发期内,伴随有肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的流行。然而,AFM的具体病因一直未能确诊,因为在不到50%的患者样本中(包括鼻咽或口咽拭子)能够检测到肠道病毒,而仅有约2%的AFM儿童在脑脊液中发现肠道病毒的核酸。因此,研究人员开始担心AFM可能是由未被识别的病原体或副感染性免疫反应所引发。

研究方法

为了明确AFM的发病原因,研究人员采用PhIP-seq技术分析了AFM患儿和对照组样本中的病毒抗体谱。这项技术能够高通量地识别数百种病毒的特异性抗体,最终的结果经过ELISA实验验证以确保其准确性。

主要研究结果

结果一:PhIP-seq技术全面分析了AFM组患儿的病毒抗体响应,发现小RNA病毒(Picornaviridae科)中的肠病毒(Enterovirus)属抗体的响应在AFM组中显著高于对照组。

结果二:数据分析显示,产生免疫原性的抗原肽段来源于整个肠道病毒基因组的蛋白质。序列分析表明,PhIP-seq技术不仅可以鉴定已知的线性表位序列,还能发现新的线性结合表位。

结果三:使用EV病毒VP1蛋白进行ELISA验证,结果显示AFM患儿组的大多数脑脊液样本中能够检测到EV信号,结果与PhIP-seq的检测结果高度一致。

研究结论

PhIP-seq技术,即噬菌体免疫沉淀测序,是一种高通量抗体谱检测技术,结合了噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序。这项技术可对数十万种抗原进行血清抗体检测,为免疫相关研究提供强有力的工具。

研究显示,利用PhIP-seq技术结合高容量的抗原库,可以帮助解析与各种疾病(包括恶性肿瘤、自身免疫疾病、病毒感染等)相关的抗体组谱。

关于南宫28

南宫28,由上海交通大学的知名教授领衔创立,致力于微生物组、抗体组领域的研究及其转化。公司专注于抗体组学前沿技术的开发,建立了PhIP-seq技术平台,并提供定制化抗原建库服务。我们的目标是为抗体组学研究提供整体解决方案。

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